MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013942	AAC	2	6	32	37	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013942	GGA	2	6	38	43	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013942	ACGG	2	8	456	463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013942	GGC	2	6	464	469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013942	GCC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013942	GCC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013942	CGT	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013942	GCG	2	6	1512	1517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013942	GTT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013942	AG	4	8	1820	1827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013942	TGA	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013942	TTG	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013942	GTAA	2	8	3071	3078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013942	TAT	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013942	TTC	2	6	3117	3122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013942	GTC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013942	TCA	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013942	CAC	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013942	CT	3	6	5481	5486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013942	A	6	6	5498	5503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013942	ACA	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013942	GTA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013942	A	6	6	5571	5576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013942	ATT	2	6	5578	5583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013942	TGC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013942	GCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013942	GT	3	6	5612	5617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013942	GCT	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013942	TTTAT	2	10	5698	5707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013942	A	6	6	5712	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013942	ATTA	2	8	6187	6194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013942	ATTTGA	2	12	6216	6227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013942	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013942	ATG	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013942	A	6	6	6699	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013942	TGA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013942	AGA	2	6	6737	6742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013942	TGA	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013942	TTC	2	6	6754	6759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013942	ATC	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013942	ATG	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013942	TA	3	6	6792	6797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013942	ACT	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013942	TAA	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013942	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013942	ATT	2	6	6945	6950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013942	TAA	2	6	6986	6991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013942	TAA	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013942	TTTA	2	8	7018	7025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013942	ATT	2	6	7035	7040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013942	AGA	2	6	7062	7067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013942	AAG	2	6	7559	7564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013942	T	7	7	7568	7574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013942	CGG	2	6	9288	9293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013942	GCC	2	6	10142	10147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013942	GAG	2	6	11920	11925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013942	ATT	2	6	11988	11993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013942	ATA	2	6	12001	12006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013942	T	7	7	12302	12308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013942	T	6	6	12356	12361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013942	TG	3	6	12422	12427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013942	G	6	6	12440	12445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013942	AT	3	6	12493	12498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013942	TAT	2	6	12507	12512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013942	TTA	2	6	12924	12929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013942	AGC	2	6	12934	12939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013942	ATTA	2	8	13201	13208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013942	TC	3	6	13300	13305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013942	A	8	8	14457	14464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013942	T	7	7	14517	14523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013942	T	6	6	14647	14652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013942	GT	3	6	14682	14687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013942	A	6	6	14727	14732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013942	TAT	2	6	14749	14754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013942	CCA	2	6	17475	17480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013942	CGTTC	2	10	17501	17510	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013942	TTC	2	6	23113	23118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013942	AACA	2	8	26065	26072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013942	AGGC	2	8	26078	26085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013942	T	7	7	26090	26096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013942	GGA	2	6	26106	26111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013942	GGTT	2	8	26135	26142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013942	GGA	2	6	26148	26153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013942	GGC	2	6	26161	26166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013942	AGG	2	6	27811	27816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013942	TAA	2	6	28675	28680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013942	A	6	6	28766	28771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013942	CGC	2	6	28891	28896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013942	GGC	2	6	29313	29318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013942	ATG	2	6	29408	29413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013942	AGA	2	6	29754	29759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013942	GCT	2	6	29761	29766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013942	TGG	2	6	29822	29827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013942	TTG	2	6	29884	29889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013942	CAG	2	6	29890	29895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013942	GAT	2	6	29904	29909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013942	A	6	6	30002	30007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013942	CTG	2	6	30008	30013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013942	GCA	2	6	30072	30077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013942	ACA	2	6	30135	30140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013942	A	6	6	30204	30209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013942	GTA	2	6	30212	30217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013942	GAG	2	6	30249	30254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013942	CGT	2	6	30567	30572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013942	GCC	2	6	30879	30884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013942	ACT	2	6	30937	30942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013942	CATT	2	8	30949	30956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013942	CCTGT	2	10	30979	30988	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_013942	GACA	2	8	30990	30997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013942	GCG	2	6	31019	31024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013942	ACA	2	6	31050	31055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013942	CA	3	6	31054	31059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013942	ACC	2	6	31066	31071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013942	CTC	2	6	31114	31119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013942	GCCCC	2	10	31134	31143	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
116	NC_013942	TGT	2	6	31183	31188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013942	CAT	2	6	31199	31204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013942	CTGG	2	8	31218	31225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013942	TCG	2	6	31302	31307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013942	TA	3	6	31514	31519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013942	TA	3	6	31525	31530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013942	AAT	2	6	32114	32119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013942	AT	3	6	32159	32164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013942	GAA	2	6	32203	32208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013942	CCG	2	6	32209	32214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013942	GCGG	2	8	32231	32238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013942	AT	3	6	32678	32683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013942	ATG	2	6	33527	33532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013942	ATT	2	6	33535	33540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013942	TATTG	2	10	33549	33558	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013942	TTGA	2	8	33559	33566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013942	G	6	6	33582	33587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013942	AGGA	2	8	33602	33609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013942	TGG	2	6	33742	33747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013942	ATG	2	6	33787	33792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013942	G	8	8	34693	34700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013942	TACT	2	8	34713	34720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013942	CAT	2	6	38721	38726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013942	CGG	2	6	39683	39688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013942	TCC	2	6	39709	39714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_013942	ATT	2	6	39795	39800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013942	GTT	2	6	40486	40491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013942	AT	3	6	40494	40499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013942	CGT	2	6	43595	43600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013942	GA	3	6	43633	43638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013942	TGG	2	6	43656	43661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013942	A	7	7	43695	43701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013942	TCAAAA	2	12	43723	43734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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150	NC_013942	TGC	2	6	46030	46035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_013942	AAT	2	6	46061	46066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_013942	AGG	2	6	48563	48568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013942	CAG	3	9	48570	48578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_013942	AAT	2	6	48585	48590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_013942	TAA	2	6	48862	48867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_013942	TAA	2	6	48897	48902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_013942	ATAA	2	8	49354	49361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013942	ACA	2	6	49389	49394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_013942	ATTT	2	8	49406	49413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013942	GAA	2	6	49427	49432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013942	ATA	2	6	49532	49537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013942	ATT	2	6	49551	49556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_013942	ATA	2	6	50940	50945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_013942	ATCT	2	8	59404	59411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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252	NC_013942	CCT	2	6	65966	65971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.